关于全球金属β-乳糖酶产生的 pseudomonas aeruginosa 的流行病学见解:基于 NCBI 数据库的全面分析

科学领域:

• 微生物学与传染病的研究
• 基因组学和生物信息学
• 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性

背景情况:

• 金属β-乳酸酶 (MβLs) 是一种关键的酶,可以对最后的抗生素类别 - - 卡巴烯产生抗药性.
• Pseudomonas aeruginosa 是一种机会性病原体,经常与医疗保健相关的感染和抗菌素耐药性有关.
• 了解P. aeruginosa中MβL基因的全球分布和遗传背景对于感染控制至关重要.

研究的目的:

• 分析 Pseudomonas aeruginosa 种群中金属β-乳糖酶 (MβL) 编码基因的全球分布和流行情况.
• 为了确定携带这些抗性基因的P. aeruginosa的特定MβL变体和序列类型 (ST).
• 评估随着时间的推移产生MβL的P. aeruginosa的趋势及其主要来源.

主要方法:

• 从NCBI数据库中检索的21,788个P. aeruginosa基因组的全基因组分析.
• 使用Prodigal进行注释,并通过Blastn.与bla_MβL数据库进行比较分析.
• 携带bla_MβL菌株的序列类型化和相关元数据的提取.

主要成果:

• 12.1%的P. aeruginosa基因组 (2,788个中的2639个) 携带了bla_MβL基因.
• bla VIM (51.2%),bla IMP (24.1%) 和 bla NDM (23.4%) 是最常见的 MβL 基因,其中 bla VIM-2,bla IMP-1 和 bla IMP-7 是主要的变异.
• 高风险克隆ST235 (16.8%) 和ST111 (16.7%) 在产生MβL的菌株中占主导地位,自1997年以来呈上升趋势,在2019年达到顶峰,主要来自人类尿样.

结论:

• 这项研究强调了全球P. aeruginosa中MβL编码基因的显著和日益增长的流行.
• 特定的MβL变体 (blaVIM-2,blaIMP-1,blaIMP-7) 与流行性高风险克隆 (ST235,ST111,ST308) 有着强烈的关联.
• 这些发现强调迫切需要加强感染预防和控制战略,以打击多药耐药P. aeruginosa的传播.