采用多模式综合基因组和免疫分析测试策略,使得测试成功率高,并检测出临床相关的生物标志物,同时优化组织使用

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 病理学 病理学 病理学

背景情况:

• 分子分析对晚期癌症患者至关重要,指导生物标志物导向疗法和精确诊断.
• 临床医生面临的挑战是,由于生物标志物清单不断扩大,从有限的瘤组织中实现最佳的生物标志物检测.
• 综合基因组和免疫分析 (CGIP) 提供了一种多模式策略,以应对日常临床护理中的这些挑战.

研究的目的:

• 在大量固体瘤标本队列中评估多模式CGIP策略的生物标志物检测率.
• 评估CGIP内部各种分子分析技术的成功率和周转时间.
• 确定通过CGIP检测到具有临床意义的生物标志物的患者比例.

主要方法:

• 在20645个固体瘤样本上进行了CGIP,包括基于DNA/RNA的下一代测序 (NGS),RNA基因表达造型和PD-L1免疫组织化学 (IHC).
• 为了最大限度地利用组织,RNA和DNA被共同提取.
• 根据联合共识建议 (AMP,ASCO,CAP) 将生物标志物的临床意义进行分类.

主要成果:

• 样本对分析的充分性因测试组件而异,PD-L1 IHC为99.8%,基于RNA的NGS为87.7%.
• 基于DNA的NGS显示>96.0%的成功率,而基于RNA的NGS和基因表达概况分别实现了92.1%和90.2%的成功率.
• 61.0%的病例有1级生物标志物,88.8%有2级生物标志物,7.7%没有检测到临床显著的生物标志物;检测率随着额外的测试方式而增加.

结论:

• 多模式CGIP测试策略表明,在固体瘤中分子分析的成功率很高.
• 这种方法有效地检测出临床相关的生物标志物,提高了精确的瘤学.
• 该策略优化了组织使用,并从有限的临床标本中改善了生物标志物产量.