生物信息学分析乳腺恶性瘤中的过氧体生物发生因子蛋白,以引入潜在的预后生物标志物

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 生物化学 生物化学

背景情况:

• 乳腺癌 (BC) 是妇女死亡的主要原因.
• 与正常组织相比,癌细胞表现出改变的代谢模式.
• 过氧体及其生物发生因子 (PEX) 在癌症代谢中起着重要作用.

研究的目的:

• 探索过氧体生物发生因子表达和乳腺癌之间的相关性.
• 确定关键的PEX蛋白作为BC的潜在生物标志物.

主要方法:

• 使用的生物信息学工具:UALCAN,GenExMiner,Metascape,STRING,Timer,卡普兰-梅尔绘图器,人类蛋白质图谱,MirTarBase和cBioportal. 这些都是我们使用的工具.
• 在BC组织中分析了PEX基因的转录水平.
• 与患者生存数据相关联的PEX表达.

主要成果:

• 在BC组织中观察到PEX基因表达的显著变化 (增加PEX6/7/10/11B/13/16,减少PEX2/3/5/11A/12/19).
• 某些PEX基因的高表达 (PEX 2/3/10/12/11G/26/13/16/14) 与更短的无复发生存时间相关.
• 较高的PEX 11B/11G/11A/12/19的mRNA表达与较长的整体存活时间有关.
• 确定了has-miR-4318和has-7106-3p作为与PEX家族相关的miRNA.

结论:

• PEX基因表达模式提供了对乳腺癌进展的见解.
• PEX蛋白质代表了BC的潜在预后生物标志物.
• 这些发现可能有助于选择乳腺癌治疗的新型治疗点.