菌的基因组挖掘 阿扎-多环天然产品 来自含有氨酸的环二
Kanji Niwa1, David A Delgadillo2, Danielle A Yee1
1Department of Chemical and Biomolecular Engineering, University of California, Los Angeles, California 90095, United States.
Journal of natural products
|June 9, 2025
概括
菌类酶称为含有氨酸的循环二合成酶 (RCDPSs) 能够发现含有氨酸的新型天然产品. 这些酶有助于创建复杂的aza-polycyclic结构,具有潜在的药物应用.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 自然产品化学 自然产品化学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
背景情况:
- 含氨酸的循环二合成酶 (RCDPSs) 是一种新型的tRNA依赖酶类,在真菌中发现.
- 这些酶生物合成循环-Arg-Xaa二,扩大含瓜尼丁的天然产品的化学多样性.
研究的目的:
- 探索编码RCDPSs的真菌生物合成基因集群 (BGCs),以发现新的aza-多环天然产品.
- 描述来自RCDPS活动的新型化合物的结构和生物合成途径.
主要方法:
- 含有RCDPS基因的真菌BGCs的生物信息挖掘.
- 使用光谱方法阐明自然产品的结构.
- 研究涉及RCDPS和相关氧化酶的酶途径.
主要成果:
- 从pno BGC中发现五环式罗英多林二基托皮佩拉 (DKPs),具有氧化循环的氨酸侧链.
- 鉴定了与来自BGC和BGC的螺旋环相关的DKP,这是瓜尼迪诺组氧化循环的结果.
- 在BGC中,一个合循环和表皮化途径的解,导致一个瓜尼迪诺桥接三环-[3.3[1,2[2.2]-piperazinedione核心.
结论:
- 菌RCDPS是多功能酶,用于生成复杂的阿扎多环自然产品.
- 描述的路径突出显示了天然产品生物合成的新型酶机制.
- RCDPSs代表了一个有前途的平台,用于发现具有潜在生物活动的新型瓜尼丁含化合物.
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