在单细胞中通过Aptamer测序 (Apt-seq) 高通量多重化定量分子

科学领域:

• 生物技术
• 分子生物学
• 基因组学

背景情况:

• 高通量测序改变了生命科学,但面临着抗体和甘氨酸等非直接测序分子的挑战.
• 现有的抗体和甘氨酸测序方法复杂,涉及固体阻碍,需要劳动密集的标记.
• 适度提供特异性,广泛准和小尺寸,使其适合多模式分子分析.

研究的目的:

• 开发Apt-seq,一个基于aptamer的高吞吐量平台,以单细胞分辨率量化多模式的omics.
• 介绍Aptomics,这是细胞表面蛋白质,甘氨酸和mRNA的并行分析的综合策略.
• 展示该平台在分析复杂的生物样本和识别新生物标志物的能力.

主要方法:

• 开发了Apt-seq,这是一个基于aptamer的测序平台,用于多模式分子分析.
• 综合性阿普坦选择和测序,用于同时定量蛋白质,甘氨酸和mRNA.
• 使用细胞系和复杂的临床样本验证平台,并将结果与流细胞测量进行比较.

主要成果:

• 在批量和单细胞分析中,apt- seq与流细胞测量有很强的一致性.
• 该平台精确地分析了临床样本中的瘤异质性,确定了与干性相关的PTK7表达子群.
• 追踪T细胞分化过程中的化动态变化,显示T细胞功能性酸增加.

结论:

• 由Apt-seq提供动力的Aptomics能够对以前非直接可测序的分子如蛋白质和糖进行测序.
• 该平台为复杂生物系统的综合分子量化提供了多功能和可扩展的解决方案.
• 通过直接和间接测序分子的同时分析,apt-seq促进了定量科学的发展.