根管感染中Enterococcus的存在基于下一代测序:系统性审查和元分析
Run-Ze Liu1, Li-An Bai1, Yi Luo1
1The State Key Laboratory of Oral & Maxillofacial Reconstruction and Regeneration, Key Laboratory of Oral Biomedicine Ministry of Education, Hubei Key Laboratory of Stomatology, School & Hospital of Stomatology, Wuhan University, Wuhan, China.
与初级感染相比,二次和持续的根管感染中,菌细菌更为普遍. 采样方法在主要根管感染中显著影响检测率.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 牙周内科医院 牙周内科医院 牙周内科医院
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 下一代测序 (NGS) 研究显示,根管感染中Enterococcus存在的结果是相互矛盾的.
- 肠球菌 (Enterococcus) 是一种可以在口腔中发现的细菌属,可能在内牙感染中发挥作用.
研究的目的:
- 为了比较Enterococcus在原发性 (PrRCI),二次性 (SRCI) 和持续性 (PRCI) 根管感染中的患病率.
- 调查影响Enterococcus检测率的因素,例如采样方法.
主要方法:
- 在主要数据库中对2005年至2024年间发表的研究进行了系统的文献搜索.
- 对16项研究进行了元分析 (选出的28项中),以汇集流行数据和赔率比率.
- 使用子组和灵敏度分析来探索与样本采集,区域和NGS平台相关的异质性.
主要成果:
- 与PrRCI相比,Enterococcus的患病率在SRCI (综合患病率:0.400) 和PRCI (综合患病率:0.444) 中显著更高 (综合患病率:0.278).
- 低温粉碎法在PrRCI (0.768) 中显示出比纸质点/仪器 (0.113) 更高的检测率.
- 肠球菌的相对丰度差异很大,在各种感染类型中通常保持在20%以下.
结论:
- 在二次和持续的根管感染中,肠球菌的患病率较高.
- 样本采集技术在初级根管感染中极大地影响了Enterococcus检测.
- 尽管某些感染类型的患病率更高,但由于其相对较低的数量,Enterococcus并不是大多数根管感染中占主导地位的属.
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