LM-GlycoRepo 1.0 版本:用于鼠标组织糖因子映射数据的新型存储系统
Chiaki Nagai-Okatani1, Noriaki Fujita1, Patcharaporn Boottanun1,2
1Cellular and Molecular Biotechnology Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 1-1-1 Higashi, Tsukuba, Ibaraki 305-8565, Japan.
Journal of proteome research
|June 11, 2025
概括
一个新的数据库,LM-GlycoRepo,已经开发了莱克微阵列 (LMA) 数据. 该系统确保了蛋白质糖化研究的 FAIR 数据原则,并支持在同行审查期间的数据共享.
科学领域:
- 格莱科米克斯 (Glycomics) 是一个有趣的药物.
- 生物技术是生物技术.
- 数据科学数据科学数据科学
背景情况:
- 莱克微阵列 (LMA) 是对蛋白质糖化定位的敏感方法.
- 越来越多地使用LMA,需要一个符合FAIR原则的数据存储库 (可查找,可访问,可互操作,可重复使用).
研究的目的:
- 介绍LM-GlycoRepo,这是一个基于莱克的多式联络 (LM) 数据的新型存储系统.
- 建立一个符合MIRAGE指导方针的系统 (用于糖化合物实验所需的最低信息).
主要方法:
- LM-GlycoRepo版本1.0旨在使用激光微解剖 (LMD) 辅助的LMA进行小鼠组织糖体映射数据.
- 该系统可以接受LMD图像,LMA数据和莱克染色图像.
- 一个禁运系统被纳入数据发布时间,与手稿同行评审兼容.
主要成果:
- LM-GlycoRepo 1.0 版本专门用于小鼠组织糖体映射数据.
- 在禁运期结束后,存储的数据可以使用LM-GlycomeAtlas网络工具进行可视化.
- 该存储库可以通过GlyCosmos门户免费访问.
结论:
- LM-GlycoRepo提供了一个符合FAIR标准的LMA和相关数据存储库.
- 该系统支持数据共享和可视化,用于糖化学研究.
- 未来的版本将容纳各种生物样本,包括人类样本.
