电子健康记录数据提取和处理对流行病学研究的影响:观察性研究
Melissa H J van Essen1,2, Robin Twickler3, Yvette M Weesie2
1Tranzo, School of Social Sciences and Behavioural Research, Tilburg University, Reitse Poort 1, RP126, Professor Cobbenhagenlaan 125, Tilburg, The Netherlands, 31 631978419.
电子健康记录 (EHR) 数据处理对研究结果产生重大影响. 提取,转化和装载 (ETL) 步骤的透明度对于使用EHR数据进行可靠的流行病学研究至关重要.
科学领域:
- 医疗信息学 医疗信息学
- 流行病学 流行病学
- 数据科学数据科学数据科学
背景情况:
- 常规记录的电子健康记录 (EHR) 数据越来越多地用于流行病学研究.
- 数据处理和准备用于二次用途可以显著影响研究成果.
- 了解数据处理决策的后果至关重要.
研究的目的:
- 调查数据处理步骤对二次EHR数据使用的研究结果的影响.
- 评估不同提取,转化和加载 (ETL) 方法对研究结果的影响.
主要方法:
- 利用来自两个研究数据库的8个荷兰一般实践 (2019年) 的EHR数据.
- 通过不同的ETL管道处理的两个数据集进行了比较,分析了三种诊断的患者人口统计,一致的患者流行病学和卫生服务使用情况.
- 评估了类似性指标,如联系人,咨询,访问,处方和使用对对样本t测试和标准偏差的情节.
主要成果:
- 在数据集之间观察到注册患者数量的差异 (47,517 vs 44,247),但患者人口统计学是相似的.
- 在数据库之间发现了对一致患者的指标结果 (联系人,处方,发作,咨询,访问) 的显著差异.
- 在三个诊断组的指标结果中没有发现显著差异,尽管标准偏差存在差异.
结论:
- 常规健康数据用户必须意识到不同ETL步骤的影响.
- 对ETL流程的透明度和共享知识对于可靠的研究至关重要.
- 提高透明度和标准化方法可以提高二次数据使用的数据互操作性.
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