液体活检方法检测HCC,并通过血cfDNA甲基组分析识别GJA4作为HBV-HCC的潜在生物标志物

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 早期发现肝细胞癌 (HCC) 对患者的生存至关重要.
• 无血细胞DNA (cfDNA) 甲基化显示出对非侵入性HCC诊断的前景.
• 现有的cfDNA甲基化标志物对于早期HCC检测缺乏敏感性.

研究的目的:

• 开发一种高度敏感的标记面板,用于使用cfDNA甲基化检测HCC.
• 为了确定新的cfDNA甲基化生物标志物用于早期HCC诊断.

主要方法:

• 使用全基因组双硫酸盐测序 (WGBS) 和向双硫酸盐测序 (TBS) 分析血cfDNA甲基化.
• 利用机器学习模型在374名参与者 (健康人,HBV,肝硬化,HCC) 中识别差异甲基化区域 (DMR).
• 使用癌症基因组图谱 (TCGA) 数据验证的发现.

主要成果:

• 对于所有HCC阶段,TBS分析达到96.67%的灵敏度和93.7%的特异性,与健康个体相比.
• 早期HCC检测显示了90.0%的灵敏度和93.75%的特异性.
• 确定了显著的DMRs,包括GJA4促进体中的一个,这是HCC发育中的潜在生物标志物.

结论:

• 血cfDNA甲基组分析为HCC检测,分期和早期诊断提供了有效的生物标志物.
• GJA4促进体的动态甲基化可以提供有关HBV相关的HCC致癌和预后的见解.