从扫描仪到科学:再利用临床获得的医学图像进行研究
Jenna M Schabdach1,2, Remo M S Williams1,2,3, Joseph Logan3,4
1Department of Child and Adolescent Psychiatry and Behavioral Science, Children's Hospital of Philadelphia, Philadelphia, PA.
概括
洛克图斯是一个新的提取,转换,加载 (ETL) 过程,简化了对临床医学成像数据的研究重复使用. 该系统高效地处理数据准备,去识别和交付,支持不断增长的研究需求.
科学领域:
- 医学成像研究研究医学成像研究
- 数据科学是数据科学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 医学成像研究需要大量和多样化的数据集.
- 利用临床获得的数据是具有挑战性的,因为复杂和耗时的转移过程.
研究的目的:
- 介绍一下Locutus,一个以显示驱动的模块化提取,转换和加载 (ETL) 过程.
- 解决临床获得的医学成像数据在研究中重复使用的困难.
主要方法:
- 洛克图斯采用了五个阶段的工作流:初始化,数据准备,提取,转换 (无标识) 和加载.
- 该过程的设计具有模块化,适应性,稳定性和工作流组件之间的通信.
- 设计指导的假设包括数据适应性,错误稳定性和人类干预的可能性.
主要成果:
- 洛克图斯工作流已经成功处理了32,962个用于研究的成像访问.
- 该系统旨在处理独特的数据交付请求,并消除敏感信息的身份.
结论:
- 洛克图斯为管理和重复使用临床医学成像数据提供了有效的解决方案.
- 未来的工作将集中在解决技术挑战和优化人类监督以提高效率.
