机器学习驱动的多种DDAs的对接作为有前途的氨酸蛋白酶抑制剂,针对Mpox病毒
Bader S Alotaibi1, Irfan Ahmad2,3, Bandar Almutairy4
1Department of Clinical Laboratory Sciences, College of Applied Medical Sciences, Shaqra University, Al- Quwayiyah, Riyadh Saudi Arabia.
In silico pharmacology
|June 12, 2025
概括
直接作用抗病毒药物 (DAA) 显示出对治疗mopox. 计算方法确定了四种DAA与mopox蛋白酶具有强烈的结合亲和力,这表明了潜在的新治疗途径.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 计算生物学 计算生物学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 像麻疹 (mpox) 这样的动物感染病毒对全球健康构成重大威胁.
- 迫切需要有效的治疗方法,特别是在脆弱人群中.
- 药物重新定位和计算建模加速治疗发现.
研究的目的:
- 通过计算方法识别潜在的直接作用抗病毒药物 (DAA) 用于治疗mopox.
- 根据与其他病毒的结构相似之处,研究DAA对mopoxcysteine蛋白酶的疗效.
主要方法:
- 使用机器学习技术 (SVM,RL,KNN) 来分析86个DAA.
- 进行了对接模拟,以评估与mopox蛋白酶的结合亲缘关系.
- 通过结构建模确定了关键的相互作用残留物.
主要成果:
- 四个DAAParitaprevir,Ledipasvir,Lenacapavir和Bictegravir显示出强烈的结合亲和力与mopox蛋白酶.
- 特定的残留物 (Cys328,Tyr270,His241,Gly329) 对结合至关重要.
- 经FDA批准的DAA被确定为潜在的mopox治疗候选者.
结论:
- 计算分析表明,某些FDA批准的DAA可以重新用于mopox治疗.
- 需要进一步的实验验证,以确认这些候选药物的治疗潜力.
- 这项研究为开发使用DAA的新型mopox疗法提供了基础.
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