多式全幻灯片图像处理管道用于组织架构和组织微环境的定量绘制
Maomao Chen1, Hongqiang Ma1,2, Xuejiao Sun1
1Departments of Medicine and Bioengineering, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA 15213 USA.
Npj imaging
|June 13, 2025
概括
我们开发了一种集成成像管道,用于详细的组织分析,结合显微镜技术进行空间分析. 这种工具有助于理解性结肠炎的粘膜愈合,并具有广泛的研究应用.
科学领域:
- 生物医学成像技术 生物医学成像技术
- 计算病理学计算病理学
- 免疫组织化学 免疫组织化学
背景情况:
- 量化高内容空间分析需要先进的成像技术.
- 了解组织结构和免疫细胞功能对于疾病研究至关重要.
研究的目的:
- 为全面的组织分析提供一个集成的图像处理管道.
- 为了使分子标记物在疾病背景下进行定量空间分析.
主要方法:
- 集成定量相位显微镜,超复合光成像和全幻灯片组织病理学.
- 开发一个开源的,兼容的图像处理管道.
- 适用于性结肠炎患者的活检,用于粘膜愈合分析.
主要成果:
- 组织结构和细胞形态学的详细形态映射.
- 在整个幻灯片中将组织形态与单个细胞的功能状态联系起来.
- 已经证明了粘膜愈合标记的定量空间分析的潜力.
结论:
- 综合管道提供了组织活检的全面分析.
- 它有助于对疾病中的分子标记物的定量空间分析.
- 该开源工具支持空间生物学领域的研究和临床应用.
