早期和现场检测甘菌诱导的棕油的基底茎腐烂:使用复合酶聚合酶放大-侧流测定

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子诊断学 分子诊断学
• 农业科学 农业科学

背景情况:

• 由Ganoderma spp.引起的基底干腐烂 (BSR) 对油棕种植构成重大经济威胁.
• 目前的检测方法通常是无效的,因为它们依赖于仅在感染后期,无法治疗的阶段出现的视觉症状.

研究的目的:

• 开发和验证一个快速的,现场诊断工具,用于早期检测油棕中的甘菌.
• 为了在无症状阶段进行检测,促进及时干预和管理.

主要方法:

• 重组酶聚合酶放大 (RPA) 反应条件的标准化,包括酸和贝他因度,化温度和时间.
• 使用纯DNA,感染油棕的原始DNA和环境样本 (土壤,茎,根) 验证RPA-侧流试验 (RPA-LFA).
• 对十种甘菌和十种其他与油棕相关的微生物进行特异性测试.

主要成果:

• RPA-LFA成功地检测到从无症状的棕油根中提取的原始DNA中的Ganoderma DNA.
• 该试验表现出高灵敏度,在30分钟内在41°C的温度下检测到只有10 pg/μL的Ganoderma DNA.
• 该方法对Ganoderma具有很高的特异性,没有观察到与其他测试微生物的交叉反应.

结论:

• 这项研究报告了第一个RPA-LFA用于检测油棕中Ganoderma诱导的基底干腐烂.
• 开发的试验提供了一个快速,灵敏和特定的工具,用于在无症状阶段早期,现场诊断BSR.
• 这种诊断能力支持油棕种植的快速有效的管理策略.