洪都拉斯的Clostridioides difficile:持续的RT027和新出现的RT002基因型的基因组和表型特征
M Andino-Molina1, M Abdel-Glil2, F Hidalgo-Villeda3
1Grupo de Investigación en Microbiología One Health, Instituto de Investigaciones en Microbiología & Escuela de Microbiología, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de Honduras, Tegucigalpa, Honduras; Institute of Bacterial Infections and Zoonoses, Friedrich-Loeffler-Institut (Federal Research Institute for Animal Health), Jena, Germany; Institute for Infectious Diseases and Infection Control, Jena University Hospital-Friedrich Schiller University Jena, Jena, Germany.
克洛斯特里迪奥伊德困难菌株,包括高病毒性RT027/ST1,在洪都拉斯医院持续存在,对关键抗生素有耐药性. 这凸显了改善感染控制策略的迫切需要和一个健康的方法来打击C. difficile感染 (CDI).
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 困难菌是一种显著的无氧性肠道病原体,在各种环境中发现,包括医疗保健机构.
- 它的子形成能力有助于生存和传播,在医院和社区环境中构成风险.
- 以前的报道表明,中美洲的C. difficile具有高毒性和多药性耐药性基因型.
研究的目的:
- 从遗传和表型上对来自洪都拉斯两个主要医院的患者的31个Clostridioides difficile分离体进行鉴定.
- 确定洪都拉斯医疗保健系统中流行的C. difficile基因型及其抗菌素耐药性概况.
主要方法:
- 全基因组测序 (第二代和第三代) 用于详细的遗传分析.
- 进行了表型抗微生物敏感性测试,以评估耐药性模式.
- 核心基因组多位置序列类型和SNP分析被用于确定遗传相关性和持久性.
主要成果:
- 确定了两种毒性基因型,即RT027 (ST1) 和RT002 (ST8).
- 所有29个RT027/ST1分离物都对莫キシ素,四环素和线化物表现出耐药性.
- RT027/ST1分离体显示出密切的遗传关系,表明自2016年以来的持久性和医院间转移;RT002/ST8分离体是敏感的.
- 与抗微生物药物耐药性相关的移动遗传元素在RT027分离物中普遍存在.
结论:
- 该研究证实了洪都拉斯存在持久的,与社区相关的Clostridioides difficile菌株.
- 这些发现强调了加强干预措施的必要性,以控制和预防C. difficile感染 (CDI).
- 一个健康的研究方法建议在洪都拉斯国家卫生系统内进行综合的C. difficile管理.
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