从小鼠缩模型中分离出的心肌细胞的独特形态特征: ImageJ 分析与机器学习算法相结合
Hoang Duc Minh Pham1, Marie-Thérèse Daher1, Onnik Agbulut1
1Sorbonne Université, CNRS UMR8263, INSERM U1345, Development, Adaptation and Ageing, Institute of Biology Paris-Seine, Paris, France.
Physiological reports
|June 20, 2025
概括
我们使用ImageJ和机器学习开发了一个标准化的工作流程,以分析心肌细胞形态在心脏缩的小鼠模型. 这种方法有效地区分健康的心脏细胞和患病的心脏细胞,并有助于治疗评估.
科学领域:
- 心脏病学 心脏病学
- 生物医学工程 生物医学工程
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 心脏缩是心力衰竭的重要危险因素.
- 对心肌细胞进行准确的形态分析对于了解疾病机制至关重要.
- 现有的心肌细胞分析方法往往是劳动密集型的,缺乏标准化.
研究的目的:
- 为分析心肌细胞形态特征建立标准化工作流程.
- 从各种小鼠心脏缩模型中识别心肌细胞中的特定形态变化.
- 开发一种高通量方法,以区分健康的心脏状态和患病的心脏状态.
主要方法:
- 优化了兰登多夫协议,用于隔离小鼠心肌细胞,达到>97%的棒状细胞.
- 开发了一个定制的ImageJ宏,结合机器学习算法进行形态分析.
- 使用高分辨率/高含量光微图进行详细的细胞分析.
主要成果:
- 成功地将分析工作流应用于来自 ангиотензин II,异二醇和年龄诱导的缩模型的心肌细胞.
- 确定了与不同类型的心脏缩相关的独特形态特征.
- 通过冷-解周期验证了工作流的能力,以保持细胞完整性,用于基因表达分析.
结论:
- 这项研究提供了一种有效和标准化的工作流程,用于对孤立心肌细胞的高通量形态和分子表征.
- 这种工作流可以作为一个强大的工具来区分健康与患病的心脏状态.
- 该方法可以评估治疗策略在逆转心脏缩方面的有效性.
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