单细胞测序揭示了thalidomide诱导的斑马鱼通过内分泌网膜应激和失调的血管信号传递引起的原性
1Center for Cleft lip and Palate Treatment, Plastic Surgery hospital, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing, China.
The Journal of craniofacial surgery
|June 23, 2025
概括
塔利多米德 (TD) 通过降解关键蛋白质,导致氧化应激和抗血管生成,导致斑马鱼形. 这项研究确定了热冲击蛋白 (HSP) 和参与TD的Notch通路基因.
科学领域:
- 发育生物学是发展生物学.
- 基因组学就是基因组学.
- 毒理学 毒理学 毒理学
背景情况:
- 塔利多米德 (TD) 是一种致病原体,通过降解蛋白质基质,如∆Np63α,TAp63α和SALL4.4等,引起形.
- 由于TD诱导的致性涉及氧化应激和抗血管生成,但具体的基因仍然不清楚.
研究的目的:
- 在单细胞水平上研究TD暴露对斑马鱼胚胎的转录组效应.
- 为了确定参与TD诱导的氧化应激和抗血管生成的基因和途径.
主要方法:
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 测序了69,115个斑马鱼细胞在受精后的1,2,5天.
- 使用STRING和Cyto-scape构建蛋白质与蛋白质相互作用 (PPI) 网络以识别枢纽基因.
- 使用基因本体学 (GO) 和基因和基因组 (KEGG) 途径的基因丰富功能分析.
主要成果:
- 在43个确定的细胞群中,TD暴露在16个细胞群中显著改变了基因表达.
- 热冲击蛋白家族基因 (HSP) 的调高,表明细胞应激反应.
- 通过Notch信号通路,her15.1,her4.3和her4.4的基因被确定为抗血管性.
结论:
- 这项研究提供了TD暴露斑马鱼胚胎的单细胞转录基因图谱.
- 热冲击蛋白 (HSP) 在细胞对TD的应激反应中起着至关重要的作用.
- 诺奇信号通路与TD诱导的抗血管生成和形有关,这与关面外科手术有关.
