通过使用血统和基因组数据,探索巴西安格斯牛群的内生抑郁症

科学领域:

• 动物遗传学和动物繁殖
• 量化遗传学 量化遗传学
• 牲畜基因组学 动物基因组学

背景情况:

• 亲生生殖抑郁症,由于亲属关系增加而导致的表现下降,是畜牧养殖的一个问题.
• 准确估计内生育对于管理遗传多样性和减轻负面影响至关重要.
• 巴西安格斯协会正式评估其牛群的各种经济重要特征.

研究的目的:

• 为了估计巴西安格斯牛的内生系数,使用六个不同的指标的血统和基因组数据.
• 评估近亲繁殖抑郁症对广泛的官方评估特征的影响.
• 探索不同类型的近亲繁殖 (例如,同胞性段的运行) 和特征表现之间的关系.

主要方法:

• 使用了13,777个基因型动物 (归因于78,837个SNP) 和530,327只血统中的动物的数据集.
• 使用六个指标计算内生繁殖:F_PED,F_GRM,F_HOM1,F_HOM2,F_UNI,和F_ROH.
• 分析的特征包括生长,形状,肉质,繁殖,外寄生虫耐药性和热应激.

主要成果:

• 通过 homozygosity (F _ROH) 的运行估计的内生育产生了最高的系数 (0.13).
• 亲生繁殖通常会产生负面影响,在毛皮特征上观察到显著的抑郁.
• 肌肉内脂肪和出生体重与近亲繁殖有积极的关联,表明特征特异性反应;较短的ROH段 (<2Mb) 的影响小于较长的ROH段 (>16Mb).

结论:

• 在巴西安格斯牛群中,近亲繁殖抑郁症是复杂且特征特定的.
• 基因组数据和各种近亲繁殖指标提供了对近亲繁殖影响的更全面的了解.
• 这些发现对遗传管理策略有价值,以减轻牲畜种群的内生影响.