人类CMV特异性CD8+ T细胞的表征使用多层单细胞奥米克
Ioanna Gemünd1, Lorenzo Bonaguro2, Matthias Becker3
1Systems Medicine, German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE), Bonn, Germany; Genomics and Immunoregulation, Life and Medical Sciences (LIMES) Institute, University of Bonn, Bonn, Germany; Department of Microbiology and Immunology, Peter Doherty Institute for Infection and Immunity, The University of Melbourne, Parkville, VIC, Australia; Institute of Virology, Technical University of Munich School of Medicine/Helmholtz Munich, Munich, Germany.
Cell reports methods
|June 24, 2025
概括
这项研究提出了一种新的多omics单细胞工作流程,用于分析免疫细胞. 该方法成功地确定了T细胞受体序列,并评估了检测抗原特异性T细胞的试剂.
科学领域:
- 免疫学和基因组学
- 单细胞多组组学分析
背景情况:
- 了解适应性免疫需要对个体免疫细胞进行详细的分析.
- 目前用于多omics单细胞数据收集的方法可能是复杂和有限的.
研究的目的:
- 建立一个全面的工作流程,用于多omics单细胞数据采集.
- 验证工作流在识别T细胞特异性和受体谱的能力.
- 评估dCODE dextramers用于检测低频抗原特异性T细胞的灵敏度和特异性.
主要方法:
- 利用基于微井的平台,同时收集整个转录组,细胞表面标记物和自适应性免疫受体谱 (AIRR) 档案.
- 采用了针对细胞表面蛋白质组的向测序,并确定了对T细胞受体序列.
- 评估了dCODE dextramers在单细胞多组体检测中的表现.
主要成果:
- 成功生成了多组单细胞数据,包括对T细胞受体序列对三种人类CMV表观体.
- 证明了工作流程能够分析T细胞特异性和AIRR.的能力.
- 量化了dCODE dextramers在低频率检测抗原特异性T细胞中的灵敏度和特异性.
结论:
- 开发的工作流提供了一种可靠的方法,用于全面的单细胞多omics分析.
- 这种方法可以对免疫细胞群体及其抗原特异性进行深入的表征.
- 这些发现支持dCODE dextramers在复杂样本中识别罕见的抗原特异性T细胞的实用性.


