从基因病理图像的深度学习算法分层化leiomyosarcoma的分子亚型:一个证明和概念的诊断研究
Shaohui He1, Jun Chen2, Yanfang Liu3
1Spinal Tumor Center, Department of Orthopaedic Oncology, No.905 Hospital of People's Liberation Army Navy, Changzheng Hospital, Naval Medical University (Second Military Medical University), 200003, Shanghai, China.
International journal of surgery (London, England)
|June 25, 2025
概括
深度学习模型准确地分类leiomyosarcoma分子亚型,并使用H&E染色幻灯片预测生存率,帮助病理学家并提高这种常见软组织肉瘤的诊断效率.
科学领域:
- 计算病理学计算病理学
- 在瘤学瘤学.
- 医学中的人工智能
背景情况:
- 乳腺髓肉瘤 (LMS) 是最常见的软组织肉瘤.
- LMS的分子亚型与预后和治疗敏感性有关.
- 准确的亚型和生存预测对于LMS患者管理至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证LMS分子亚型化深度学习 (DL) 算法.
- 开发和验证DL算法,用于预测LMS存活率.
- 评估DL衍生的组织形态学特征在协助病理学家中的实用性.
主要方法:
- DL模型使用来自癌症基因组图谱 (TCGA) 的全幻灯片图像 (WSI) 进行训练.
- 外部验证是在多中心,现实世界的队列上进行的.
- 性能指标包括AUROC,精度,回忆,特异性,精度和F1分数. 计算可视化 (CVs) 用于解释DL模型.
主要成果:
- 在LMS-DL模型中,分子亚型的AUROC为0.944,预测两年总生存的AUROC为0.937.
- DL模型在亚型准确性方面超过了病理学家的30%以上.
- 简历使病理学家的亚型准确度提高了12.1%,诊断时间和不确定性减少.
结论:
- DL模型在LMS分子亚型和生存预测中显示出高准确性和有效性.
- 这些模型可以显著减少病理学家的工作量.
- 需要在大型潜在队列中进一步验证.
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