在纤维化中通过全转录组测序识别核心非编码RNA相关的竞争性内源RNA网络

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 腎病理生理學 腎病理生理學

背景情况:

• 纤维化 (RF) 是慢性病的常见途径.
• 了解RF中ncRNAs的调节机制对于开发治疗策略至关重要.

研究的目的:

• 调查不同纤维化 (RF) 模型中的非编码RNA (ncRNA) 表达变化.
• 识别重叠的差异表达 (DE) ncRNA,并构建核心竞争的内源性RNA (ceRNA) 网络.
• 探索这些ncRNA和ceRNA网络在射频病原发生中的作用.

主要方法:

• 建立了三种不同的射频老鼠模型 (5/6腎切除,腺素,單邊尿路阻塞).
• 进行全转录组RNA测序以识别DERNA,通过RT-qPCR验证.
• 使用Cytoscape构建基于lncRNA和circRNA的ceRNA网络,并通过光酶试验,FISH,西斑和IHC验证了核心轴.

主要成果:

• 在所有射频模型中确定了215个mRNA,19个lncRNA和247个circRNA作为重叠的DERNA.
• 构建基于lncRNA的ceRNA网络 (7个lncRNA,8个miRNA,21个mRNA) 和基于circRNA的网络 (13个circRNA,29个miRNA,41个mRNA).
• 发现了保存的ceRNA轴TCONS_00008870/circRNA_3140-miR-466b-3p-Adamts2作为RF的一个关键调节途径.

结论:

• 在多个射频模型中确定了保存的ncRNA失调和ceRNA网络.
• 环RNA_3140-miR-466b-3p-Adamts2轴是脏组织中纤维化进展的潜在关键调节器.
• 这些发现为RF背后的分子机制提供了新的见解.