用ABLUP,GBLUP和ssGBLUP方法对内蒙古克什米尔山羊的早期生长特征进行基因组选择
Tao Zhang1,2, Linyu Gao1,3,4, Bohan Zhou1,3,4
1College of Animal Science, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China.
Animals : an open access journal from MDPI
|June 26, 2025
概括
内蒙古克什米尔山羊 (IMCGs) 的基因组选择确定了改善早期生长特征的最佳模型和方法. 使用全面动物模型的ssGBLUP方法证明了基因组估计育种值 (GEBV) 的卓越准确性.
科学领域:
- 动物遗传学和动物繁殖
- 量化遗传学 量化遗传学
- 牲畜基因组学 动物基因组学
背景情况:
- 早期的生长特征对于喀什米尔山羊的生产至关重要.
- 基因组选择有可能加速遗传收益.
- 确定最佳模型和方法对于有效的基因组选择至关重要.
研究的目的:
- 确定内蒙古克什米尔山羊 (IMCGs) 早期生长特征的最有效的基因组选择模型和方法.
- 用不同的方法评估基因组估计育种值 (GEBV) 的准确性和可靠性.
- 为了估计关键生长特征的遗传性.
主要方法:
- 利用了SNP数据 (50,728),来自2256个个体的表型数据 (出生体重,断奶体重,每日体重增加,年龄体重),以及来自14,165个个体的血统数据.
- 使用通用线性模型分析固定效应,并使用ABLUP,GBLUP和ssGBLUP方法评估四种单一特征动物模型.
- 采用概率比测试用于模型选择和五倍交叉验证用于GEBV准确性评估.
主要成果:
- 出生年份,群体,性别,出生类型和母体年龄显著影响了生长特征 (p < 0.05或p < 0.01).
- 模型4,包括直接和母体影响,母体环境和它们的协变,被认为是最佳的.
- 该ssGBLUP方法实现了最高的GEBV精度 (0.61-0.70),超过了GBLUP和ABLUP.
- 对于出生体重,断奶体重,每日体重增加和年龄体重的遗传概率分别为0.11,0.25,0.15和0.23.
结论:
- 由于其优越的GEBV准确性,建议使用ssGBLUP方法来增强IMCG的遗传进展.
- 最佳模型包括直接和母性附加遗传效应,以及母性环境效应.
- 准确的基因组评估对于高效的喀什米尔山羊育种计划至关重要.
