在动物便中检测SARS-CoV-2的RT-LAMP的评估
Aimee Pepper1, Sandipty Kayastha1, Megan Miller2
1Veterinary Diagnostic Laboratory, Department of Veterinary Clinical Medicine, University of Illinois College of Veterinary Medicine, Urbana, IL 61802, USA.
Viruses
|June 27, 2025
概括
一种新的RT-LAMP试验有效地检测动物便中的SARS-CoV-2RNA. 这种快速的护理点测试为动物监测和控制提供了高灵敏度和特异性.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 分子诊断学 分子诊断
- 一个健康监测
背景情况:
- SARS-CoV-2 (严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2) 呈现出广泛的宿主范围和动物感染潜力,需要加强动物监测.
- 像rRT-PCR这样的现有检测方法需要专门的设备,限制了在各种环境中快速部署.
研究的目的:
- 为了验证一种商业化,基于pH值的色度测量反转录环介导放大 (RT-LAMP) 试验,用于检测动物便中的SARS-CoV-2RNA.
- 与RT-PCR相比,评估RT-LAMP试验的诊断性能,特异性,稳定性和可重复性.
主要方法:
- 使用动物便样本进行商业RT-LAMP试验的验证.
- 与参考标准进行实时逆转录聚合酶链反应 (rRT-PCR) 的比较.
- 检测极限的确定,针对其他冠状病毒的特异性,以及测试稳定性 (潜伏时间,温度,体积).
主要成果:
- 该RT-LAMP试验显示了72个基因组拷贝/反应的检测极限,以及对SARS-CoV-2的高特异性.
- 对高病毒载量 (Ct ≤ 25),中等至高病毒载量 (Ct ≤ 33) 的诊断灵敏度为97.4%,整体 (Ct ≤ 40) 的诊断灵敏度为100%.
- 诊断特异性为97.9%,通过盲检测证实可复制性.
结论:
- RT-LAMP为在动物便中检测SARS-CoV-2提供了一个快速的,即时的替代方案,特别是对于具有中度至高病毒载荷的样本.
- 这种验证的测试可以促进在动物种群中更早地实施控制措施,从而为"一健康"战略做出贡献.
- 该测试的稳定性和易用性使其适合在动物监测计划中的现场部署.
