在两个子母线中,肠道微生物对热应激的不同反应:使用Random Forest,BayesC和PLS-DA进行比较分析
Iliyass Biada1, Francesco Tiezzi2, Noelia Ibáñez-Escriche1
1Instituto de Ciencia y Tecnología Animal, Universitat Politècnica de València, València, Spain.
Journal of animal science
|June 27, 2025
概括
热应激会影响子的肠道微生物,改变多样性并可能增加病原体风险. 高寿命线显示弹性,而低寿命线更容易受到影响,表明微生物群作为热应激弹性生物标志物.
科学领域:
- 动物科学动物科学
- 微生物学 微生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 热应激对牲畜,特别是子产生负面影响,因为它们很脆弱.
- 了解遗传学,环境和肠道微生物群之间的相互作用对于动物健康和生产力至关重要.
研究的目的:
- 为了研究热应激对软便微生物群的影响,在两个不同寿命的子遗传线上.
- 为了确定潜在的微生物生物标志物用于子的热应激弹性.
主要方法:
- 一个2x2的因数设计暴露了标准 (A) 和高寿命 (LP) 的子线,以应对热应力和热舒适.
- 使用多种建模方法 (随机森林,PLS-DA,BayesC) 分析软便微生物群组成.
- 评估了微生物多样性 (α和β) 和预测模型的性能.
主要成果:
- 热应激显著改变了微生物多样性,增加了α多样性和转移β多样性.
- 高寿命线 (LP) 在热舒适下显示出更高的微生物丰富性,但热应力使这些差异相等.
- 像Erysipelatoclostridium和Monoglobus这样的特定种类在热应激下的低寿命线 (A) 中更为丰富.
- 部分最小平方区分分析 (PLS-DA) 在区分微生物概况方面表现出最高的准确性.
结论:
- 软便微生物群的组成受到热应激和宿主遗传的影响,这对子的弹性有影响.
- 高寿命线 (LP) 似乎更适应热应激,可能是由于宿主-微生物群相互作用.
- 软便微生物群作为评估子耐热应激能力的潜在生物标志物.
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