跨队列多组组分析确定了在结直肠癌中由EMT签名驱动的新型集群

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 结肠直肠癌 (CRC) 呈现出显著的异质性,影响患者的预后和治疗反应.
• 了解CRC的分子机制对于开发精密疗法至关重要.

研究的目的:

• 系统地描述CRC中的瘤细胞异质性.
• 探索已识别的瘤细胞亚型的临床影响.

主要方法:

• 整合了五个单细胞RNA测序队列 (70个CRC样本,164,173个细胞).
• 基于VEGFR+瘤细胞特征基因进行的无监督聚类,用于患者分层.
• 通过 in vitro,in vivo,分子对接和动力学模拟验证了关键分子机制.

主要成果:

• 鉴定了五种不同的瘤细胞亚型,包括与上皮细胞-介质细胞过渡 (EMT),转移和不良结果相关的VEGFR+亚型.
• 根据VEGFR+特征基因,分层CRC患者分为三个亚组 (C1-C3);C3亚组显示出高转移潜力,茎状性质和免疫抑制微环境,五年生存率低于50%.
• 确定HOXC6是C3亚型的关键驱动因素,HOXC6的淘汰会抑制CRC的进展. 在体内,Abemaciclib显示与HOXC6结合,并抑制CRC细胞功能和瘤生长.

结论:

• 建立了CRC的第一个单细胞分辨率分子分类系统.
• 描述了EMT亚型与转移性进展之间的联系.
• 确定HOXC6作为CRC精密瘤学的新型治疗标.