单细胞地图的现状 生物文学中的数据可视化

科学领域:

• 单细胞生物学 单细胞生物学
• 生物信息学是一种生物信息学.
• 数据可视化数据可视化

背景情况:

• 最近的进展允许组织样本的单细胞分析.
• 对单细胞数据的分析有助于疾病的理解和治疗的发展.
• 大规模的"亚特拉斯"项目正在对细胞原型,生物标记物和空间位置进行编目.

研究的目的:

• 调查目前使用可视化技术来解释单细胞地图数据集的现有使用情况.
• 识别在可视化大规模,高分辨率和异质单细胞数据方面的挑战和机会.
• 为可视化社区提供一个基础资源,解决新兴的亚特拉斯规模数据集.

主要方法:

• 评估了来自45个生物学出版物的1800多个数据面板.
• 在单细胞地图集数据解释的背景下分析了可视化方法的应用.

主要成果:

• 确定了在单细胞地图研究中使用的常见和新的可视化策略.
• 突出了数据大小,分辨率和异质性对可视化选择的影响.
• 提供了关于可视化如何有助于发现健康和疾病中的生物功能的见解.

结论:

• 可视化对于解释复杂的单细胞地图数据至关重要.
• 了解当前的可视化实践是必不可少的,因为亚特拉斯规模的数据集正在迅速出现.
• 这项调查是指导单细胞生物学未来可视化开发的资源.