鼠标脂肪细胞的表观基因组地图
Laura C Hinte1, Adhideb Ghosh2, Daniel Castellano-Castillo1
1Laboratory of Nutrition and Metabolic Epigenetics, Institute of Food, Nutrition and Health, Department of Health Sciences and Technology, ETH Zurich, Switzerland.
Molecular metabolism
|June 29, 2025
概括
表观遗传学分析揭示了脂肪细胞中的独特的组质子标记,区分细胞类型和起源. 这项研究为了解脂肪细胞表观基因组调节及其在代谢健康中的作用提供了宝贵的资源.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 代谢研究研究 代谢研究
背景情况:
- 表观遗传修饰,包括基因组翻译后修饰,影响脂肪细胞基因表达,并与代谢功能障碍,肥胖和胰岛素抵抗有关.
- 在不同脂肪库和多种修改中对体内脂肪细胞表观基因组的表征仍然具有挑战性.
研究的目的:
- 在不同的存储和条件下,在体内表观遗传学上表征脂肪细胞.
- 为了确定棕色,色和白色脂肪细胞之间的表观遗传差异.
- 探索调控脂肪细胞身份和基因调控的调控元素.
主要方法:
- 使用记者小鼠标记棕色,色和白色脂肪细胞.
- 采用喉毒素介导的除方法去除色脂肪细胞.
- 通过使用Cleave Under Targets和标记 (CUT&Tag) 来生成五个基因素标记 (H3K4me3,H3K27me3,H3K4me1,H3K27ac,H3K9me3) 的配对单细胞数据集.
- 在冷暴露和热中立条件下,对来自三个不同的脂肪组织存储库的数据进行了综合性多组分因子分析 (MOFA).
主要成果:
- 增强剂根据来源组织区分脂肪细胞;H3K4me1沉积区分色和棕色脂肪细胞.
- 色脂肪细胞在变暖期间表现出热源基因的平衡促进体.
- 色脂肪细胞的切除表明非色白色脂肪细胞和色脂肪细胞具有共同的祖先,缺乏固有的表观遗传区别.
结论:
- 生成的配对多式联络数据为探索小鼠脂肪细胞表观基因组提供了全面的资源.
- 这一资源将有助于发现控制脂肪细胞身份和基因表达的调控元素.
- 这些发现提供了对脂肪细胞功能表观遗传基础和对代谢疾病的潜在治疗点的见解.
