对比基因组学和转录基因组学确定了Rhizoctonia solani的AG-7细胞染色体P450基因RsCYP-1对pencycuron的耐药性

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 菌类学 菌类学是指菌类学.
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 在全球范围内,Rhizoctonia solani会对农作物造成重大破坏.
• 潘西库隆的真菌杀菌剂耐药性在R. solani的解组 (AGs) 之间有所不同,特别是AG-7.

研究的目的:

• 调查Rhizoctonia solani AG-7中的pencycuron耐药性的基因组和转录基因组基础.
• 为了比较一个对pencycuron敏感的分离物 (No.214) 和一个耐药的分离物 (No.213).

主要方法:

• 他们使用了全基因组测序 (PacBio) 和RNA测序 (Illumina RNA-seq).
• 分析了基因组和转录组数据,以确定敏感和耐药分离物之间的差异.
• 候选耐药性基因的功能验证在Monilinia fructicola中进行.

主要成果:

• 敏感的分离物 (第214号) 拥有五体基因组,具有全基因组重复和广泛的转录变化,但缺乏关键的排毒基因.
• 耐药分离物 (第213号) 具有双倍体基因组,并表现出对异生生物排毒基因的转录上调,包括P450 (RsCYP-1).
• 在功能测试中证实rsCYP-1在功能测试中赋予了pencycuron耐药性.

结论:

• 在R. solani AG-7的基因组复杂性可能会影响pencycuron的敏感性.
• 细胞染色体P450介导的解毒是赋予R. solani. pencycuron耐药性的关键机制.