通过双重序列测序对突变量化的可转移性,可复制性和敏感性
Shaofei Zhang1, Barbara L Parsons2, Devon Fitzgerald3
1Pfizer Worldwide Research, Development, and Medical, Groton, Connecticut, USA.
Environmental and molecular mutagenesis
|June 30, 2025
概括
双重测序 (DS) 是一种错误纠正的下一代测序方法,在多个实验室中显示出高可重现性和灵敏性,用于多种致变性测试. 这项技术适用于监管应用,在遗传毒理学研究中准确检测突变.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 双重测序 (DS) 是一种超精确,错误纠正的下一代测序 (ecNGS) 技术.
- 监管性突变性测试需要验证的,可复制的方法.
研究的目的:
- 为了评估DS的可转移性,可复制性和敏感性,进行监管性突变性测试.
- 评估DS在不同实验室的适用性,包括那些有或没有以前经验的实验室.
主要方法:
- 设计了一项重建实验,使用来自对照和原治疗大鼠的DNA ([a]pyrene和N-ethyl-N-nitrosourea).
- 突变频率 (MF) 标准是通过混合DNA样本来创建的.
- 这些标准分发给八个实验室,用于DS库的准备和分析.
主要成果:
- 所有参与实验室都成功准备了DS库,并生成了高质量的测序数据.
- 测量的突变频率和光谱在所有地点都高度一致.
- 与对照组相比,DS可靠地检测到突变频率增加了2倍.
结论:
- 双重测序显示出高的技术可重复性和可转移性,用于突变致病性评估.
- DS的敏感性和一致性支持其适用于监管性遗传毒理学测试的适用性.
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