代谢途径的系统查,以识别具有不同免疫特征的两种乳腺癌亚型
Xiangshu Cheng1, Shuhao Zhang1, Xin Meng1
1College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, 157 Baojian Road, Nangang District, Harbin, Heilongiiang Province, China.
Scientific reports
|July 2, 2025
概括
乳腺癌 (BRCA) 患者表现出代谢异质性,影响治疗反应. 这项研究确定了两种不同的BRCA代谢亚型 (BCMS),具有不同的免疫特征,预后和药物敏感性,为个性化治疗铺平了道路.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 代谢途径 代谢途径
- 瘤微环境是一个微环境.
背景情况:
- 乳腺癌 (BRCA) 患者的异质性限制了治疗疗效.
- BRCA细胞的代谢可塑性有助于异质性,并影响瘤免疫微环境 (TIME).
- 目前缺乏对BRCA代谢途径的系统评估.
研究的目的:
- 为了识别和描述乳腺癌 (BRCA) 的不同代谢亚型.
- 研究代谢亚型,免疫透,临床预后和药物敏感性之间的关系.
- 建立一个新的乳腺癌代谢亚型系统 (BCMSS),用于精确诊断和个性化治疗.
主要方法:
- 在TCGA BRCA队列 (n=1094) 中26个KEGG/反应体通路的共识聚类.
- 使用随机森林分类对9个独立的批量转录组队列 (n>4000) 的验证.
- 多omics分析包括功能丰富 (GSEA),免疫透 (Mcpcounter),药物敏感性 (oncoPredict),细胞间通信 (CellChat) 和空间分析 (CellTrek).
主要成果:
- 确定了两个不同的BRCA代谢亚型 (BCMS):BCMS-I (脂质代谢,免疫激活,更好的预后) 和BCMS-II (氨基酸/维生素代谢,增殖,更差的预后).
- BCMS-I显示了较高的免疫细胞透和与免疫细胞的空间同定位,并激活了MHC信号通路.
- BCMS-II表现出瘤细胞增殖,缺乏免疫透,并对包括Ganitumab和Pembrolizumab在内的特定疗法表现出敏感性.
结论:
- 建立了基于代谢途径分析的新型乳腺癌代谢亚型系统 (BCMSS),突出了BRCA异质性.
- BCMSS将代谢特征与免疫特征,临床预后和药物敏感性相关联.
- 这种分类系统为精确诊断和乳腺癌个性化治疗策略提供了宝贵的见解.
