黄类生物标志物和共同表达基因网络的特征在于通过多omics通过十个Hemerocallis citrina加入
Tao Ma1, Hui Wang1, Xinli Yue1
1High Latitude Crops Institute, Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Shanxi Agricultural University, Datong, Shanxi, 037008, People's Republic of China.
Scientific reports
|July 2, 2025
概括
海默洛卡利斯 (Hemerocallis citrina) 的花含有多种类型的黄酸盐,其中具有显著的代谢差异,可以区分食用和非食用品种. 这项研究确定了关键的黄类标记物和基因,为药物和食品应用提供了洞察力.
科学领域:
- 植物代谢学 植物代谢学
- 生物化学 生物化学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- (H. citrina) 是一种用于食品和药物的传统植物,以其丰富的生物活性黄酸盐含量而闻名.
- 了解H. citrina的代谢概况对于其有效利用和品种区分至关重要.
研究的目的:
- 为了研究和表征H. citrina花中的黄类代谢物,跨越不同的连接.
- 确定差异性黄类代谢物和相关基因,以区分食用和非食用H. citrina.
- 为H. citrina.的食品和医疗应用提供理论基础.
主要方法:
- 基于UPLC-MS/MS的代谢学被用来识别和量化H. citrina花中的黄和素,来自十个加入.
- 进行了差异化代谢物分析,层次聚类和ROC分析,以确定关键的黄类标记物.
- 转录组分析与代谢学相结合,确定了参与类生物合成的差异表达基因 (DEGs).
- 用皮尔森的相关性分析,WGCNA和qRT-PCR来确定黄类基因相关性并验证基因表达.
主要成果:
- 总共有642种黄胺和14种胺被确定,黄醇和黄是最丰富的黄胺类.
- 鉴定了309种不同的黄类代谢物,清楚地区分了7种可食用的加入和3种不可食用的加入.
- 确定了14种重要的黄类标记物和47种与黄类生物合成相关的DEG,其中13种DEG和4种转录因子可能调节这些代谢物.
- 用qRT-PCR验证了转录组数据,证实了基因表达模式的一致性.
结论:
- 在H. citrina的加入中存在着黄类的显著代谢变异,使得可食和不可食类型的区分成为可能.
- 已经确定了关键的黄类代谢物及其相关调节基因,为生物合成途径提供了洞察力.
- 这项研究为H. citrina在食品和医药领域的应用以及市场质量控制提供了科学基础.
