综合转录组分析显示,MSTRG.19853.1/ssc-miR-361-3p/NPPA轴与西藏猪的低氧适应有关

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学
• 生理学 生理学 生理学

背景情况:

• 西藏猪具有对高海拔低氧的自然耐受性.
• 非编码RNAs (ncRNAs) 参与了低氧适应.
• 在西藏猪心脏适应中mRNA-ncRNA网络的调节作用尚不清楚.

研究的目的:

• 在高海拔条件下调查西藏猪和约克郡猪的转录形状.
• 识别心脏组织中差异表达的RNA及其相互作用.
• 阐明西藏猪中低氧适应的调节机制.

主要方法:

• 来自西藏猪 (TH) 和约克郡猪 (YH) 的心脏组织的全转录组测序.
• 对mRNAs,lncRNAs和miRNAs的差异表达分析.
• 构建一个竞争的内源RNA (ceRNA) 网络.
• 使用qRT-PCR和双露西法酶记者分析验证一个特定的监管轴.

主要成果:

• 鉴定了795个差异表达的lncRNA,149个差异表达的miRNA和2,206个差异表达的mRNA.
• 功能性丰富分析揭示了与低氧适应相关的途径,包括扩张性心肌病 (DCM) 和多变性心肌病 (HCM).
• 构建了一个ceRNA网络,并验证了MSTRG.19853.1/ssc-miR-361-3p/NPPA轴作为心脏适应的潜在调节器.

结论:

• 在低氧状态下的西藏猪心中阐明了全面的RNA表达特征和ncRNA-mRNA相互作用.
• MSTRG.19853.1/ssc-miR-361-3p/NPPA轴是调节心脏适应缺氧的一个有希望的候选者.
• 这些发现为西藏猪高海拔适应的遗传机制提供了洞察力.