长读序列的应用在杜琴/贝克尔肌肉发育不良的诊断:揭示复杂的结构变异和深层内部突变
Yixuan Chu1,2, Ciliu Zhang1,2, Zou Pan1,2
1Department of Pediatrics, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, 410008, Hunan, China.
Italian journal of pediatrics
|July 2, 2025
概括
长读序列测试 (LRS) 在标准测试失败时有效诊断杜氏/贝克尔肌肉发育不良症 (DMD/BMD) 的复杂遗传突变. 将LRS与肌肉活检和RNA测序相结合,可以提高具有挑战性的病例的诊断准确性.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 分子生物学分子生物学
- 医学诊断 医学诊断 医学诊断
背景情况:
- 多重联结依赖探头放大 (MLPA) 和下一代测序 (NGS) 是杜氏/贝克尔肌肉发育不良 (DMD/BMD) 遗传诊断的标准.
- 这些传统方法面临着复杂的遗传重组和深层内在突变的局限性.
- 长读测序 (LRS) 提供更长的读取长度,使得复杂的遗传变异的检测.
研究的目的:
- 评估长读测序 (LRS) 在诊断具有复杂遗传背景的患者的杜琴/贝克尔肌肉发育不良 (DMD/BMD) 的疗效.
- 将LRS与MLPA和WES等已建立的方法进行比较,以识别致病变体.
- 探索用于标准基因检测无法解决的病例的补充诊断方法.
主要方法:
- 长读序列测序 (LRS) 对五名疑似患有DMD/BMD的儿科患者进行了测序.
- 之前的基因测试 (MLPA,WES) 在四名患者中未能确定致病突变.
- 肌肉活检和RNA测序被用于全面分析,特别是在具有挑战性的病例中.
主要成果:
- 在四名以前未经MLPA和NGS诊断的患者中,LRS成功识别了复杂的遗传变异,包括转位,逆位和深层内基突变.
- 对于第五名患者,LRS最初没有显示任何突变,但随后的肌肉活检和RNA测序显示出部分19元突变删除,证实了诊断.
- 该研究表明,LRS有能力发现DMD/BMD的遗传原因,而这些遗传原因被传统技术遗漏了.
结论:
- 长读测序 (LRS) 非常有效地检测DMD/BMD的复杂结构变异和深层内基突变,克服了当前方法的局限性.
- 整合肌肉活检和RNA测序可以提高未解决遗传发现的患者的诊断产量.
- 随之而来的是,LRS将成为常规基因检测的宝贵补充,改善更广泛的DMD/BMD患者的诊断精度.
