在狗乳腺瘤单细胞中,CEBPD通过染色质可访问性来调节CD47和MAP4K4
Jeong-Woon Lee1,2,3, Dabin Lee1, Kyung-Ju Shin1
1Department of Biochemistry, College of Veterinary Medicine, Seoul National University, Seoul, 08826, Korea.
Scientific reports
|July 2, 2025
概括
研究瘤携带狗的免疫细胞中的染色质可访问性揭示了免疫和代谢基因附近的关键变化. 这些发现突出了潜在的表观遗传生物标志物和癌症免疫调节的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 癌症患者的免疫细胞表现出改变的特征,提供潜在的诊断生物标志物.
- 瘤相关免疫细胞中的表观遗传机制,特别是染色质可访问性,尚不清楚.
研究的目的:
- 调查乳腺瘤的狗外围血液单核细胞 (PBMC) 中的染色质可访问性和转录因子结合.
- 识别可能导致癌症免疫反应的表观遗传变化.
主要方法:
- ATAC-seq (使用测序测定转化酶可访问染色质) 测试对来自健康狗和乳腺瘤的狗的PBMC进行了测试.
- 分析的重点是确定染色质可访问性和转录因子结合位点的差异.
- 鉴定目标的基因表达在癌症共同培养条件下在单细胞中得到验证.
- 使用CRISPR干扰来评估监管区域的功能影响.
主要成果:
- 在免疫功能,神经元活动和脂质代谢相关的基因附近观察到染色质可访问性的显著变化.
- 特定的CEBPD结合部位在瘤携带犬的PBMC中被上调.
- 在与癌细胞共同培养的单细胞中证实了CD47和MAP4K4基因转录的升级.
- 克里斯普尔干扰减少了这些基因的转录上调,这表明了已识别的区域的调节作用.
结论:
- 染色体可访问性在塑造对癌症的免疫反应方面发挥着重要作用.
- 循环免疫细胞中的表观遗传修饰可以作为瘤存在的潜在生物标志物.
- 已确定的调节区域和相关基因 (CD47,MAP4K4) 代表调节抗癌免疫反应的潜在治疗标.
