全基因组的CRISPR淘汰屏幕识别了激活转录因子 (ATF1) 作为HIV基因表达的激活剂
Alona Kuzmina1, Seraj Wattad1, Praveenkumar Murugavelu1
1The Shraga Segal Department of Microbiology Immunology and Genetics, Faculty of Health Sciences, Ben-Gurion University of the Negev, Be'er Sheva, Israel.
mBio
|July 3, 2025
概括
激活转录因子1 (ATF1) 驱动人类免疫缺陷病毒 (HIV) 基因表达,通过结合HIV促进体和调节宿主因子. 削减ATF1促进HIV潜伏期,为病毒储存库提供潜在的治疗点.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 抗逆转录病毒疗法 (ART) 可以控制人类免疫缺陷病毒 (HIV),但不能消除潜伏的病毒储存.
- 长寿细胞中持久的,转录性沉默的前病毒是治愈艾滋病毒的主要障碍.
- 了解调节HIV转录的宿主因素对于准储库至关重要.
研究的目的:
- 为了确定激活人类免疫缺陷病毒 (HIV) 基因转录的宿主因素.
- 研究激活转录因子1 (ATF1) 在HIV基因表达和潜伏中的作用.
- 阐明ATF1调节HIV转录及其与宿主细胞机械相互作用的机制.
主要方法:
- 在CD4+T细胞中全基因组的CRISPR淘汰屏幕用于识别HIV基因调节者.
- 功能增加和丧失实验,以评估ATF1在HIV潜伏期中的作用.
- 染色体免疫沉 (ChIP) 测定ATF1与艾滋病毒促进体结合.
- 对RNA聚合酶II招募和H3K9me3基因素标记的分析.
- 研究ATF1的全基因组结合及其对细胞基因表达的影响,包括CCR5反感 lncRNA.
主要成果:
- 确定ATF1是HIV基因转录的关键激活剂,在具有活跃前病毒的细胞中表达更高.
- ATF1的耗尽促进了艾滋病毒的潜伏期,表明它在维持病毒基因表达中的作用.
- ATF1直接与艾滋病毒促进体结合,调节RNA聚合酶II招募和H3K9me3水平.
- ATF1 调节 CCR5 反感 lncRNA,间接控制 CCR5 同受体表达,从而控制 HIV 感染.
结论:
- 通过直接和间接的机制,ATF1是HIV基因转录的关键激活剂.
- ATF1对HIV基因表达的调节及其在促进病毒延迟中的作用是潜在的治疗点.
- 准ATF1可能为操纵艾滋病毒储存库的大小和朝着治愈前进提供新的策略.
