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Updated: Sep 17, 2025
10:37
Induction and Analysis of Epithelial to Mesenchymal Transition
Published on: August 27, 2013
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使用转录组学和单细胞测序,识别与表皮细胞-介质细胞过渡和肝细胞癌中anoikis相关的预后生物标志物
Maobing Wang1, Lu Cheng2,3,4,5, Kuo Qi2,3,4,5
1The First School of Clinical Medicine, Lanzhou University, Lanzhou, China.
Frontiers in cell and developmental biology
|July 4, 2025
概括
这项研究确定了五种与上皮细胞-介质细胞过渡相关的基因 (EMTRGs) 和与基相关的基因 (ARGs) 作为肝细胞癌 (HCC) 的新生物标志物. 这些生物标志物显示出预测患者预后和指导HCC治疗策略的潜力.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 表皮-介质细胞过渡 (EMT) 和阿诺基斯与肝细胞癌 (HCC) 的发展有关.
- 在HCC病变发生过程中,EMT和anoikis的精确机制需要进一步阐明.
研究的目的:
- 探索EMT相关基因 (EMTRGs) 和anoikis相关基因 (ARGs) 在HCC中的作用.
- 为了确定HCC预后和治疗的新生物标志物.
主要方法:
- 利用TCGA-HCC,ICGC-LIPI-JP和GSE149614数据集的数据,包括单细胞RNA测序.
- 采用差异表达分析,加权基因共同表达网络分析 (WGCNA) 和RT-qPCR用于生物标志物识别和验证.
- 为预后预测构建了风险模型和名录,并进行了丰富和免疫微环境分析.
主要成果:
- 确定了LAMA4,C7,KPNA2,STMN1和SF3B4作为HCC的重要生物标志物.
- 开发的风险评分是一个独立的预后因素,而名图显示出对患者生存的良好预测准确性.
- 生物标志物在HCC组织和树皮细胞中表达差异,在风险得分和药物敏感性之间发现了显著的关联.
结论:
- 五个EMTRG和ARG (LAMA4,C7,KPNA2,STMN1,SF3B4) 被确定为HCC的潜在生物标志物.
- 这些生物标志物为HCC病原体提供了新的见解,并可能有助于开发向疗法.
