在29个月的纵向研究中,在城市废水中监测SARS-CoV-2的不同方法中的一致趋势

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 公共卫生病毒学.
• 分子诊断学 分子诊断学

背景情况:

• 污水监测对于社区疾病监测至关重要,但缺乏标准化的SARS-CoV-2检测工作流.
• 之前对方法进行比较的研究在持续时间和范围上是有限的.

研究的目的:

• 为了比较两个不同的SARS-CoV-2废水监测工作流程在长时间内.
• 评估工作流程的可靠性和与临床数据的相关性.
• 评估样本存储对SARS-CoV-2RNA量化的影响.

主要方法:

• 亲和度列与超过废水处理的比较.
• 使用RT-qPCR对SARS-CoV-2RNA进行量化,使用基于DNA和基于RNA的标准.
• 在加拿大阿尔伯塔省的五个净化厂,分析了29个月的1482个样本的数据.
• 对胡轻度斑点病毒进行评估,以确定样品储存条件的正常化和影响.

主要成果:

• 这两种工作流表都与彼此以及临床COVID-19病例数据有很好的相关性.
• 不同的工作流程有效监测了废水中的SARS-CoV-2趋势.
• 使用胡温和斑点病毒的正常化在工作流之间是不一致的.
• 冷样本显著减少了可检测的SARS-CoV-2RNA;+4°C的储存是一致的.

结论:

• 多个废水处理工作流可以有效和可靠地监测社区的COVID-19负担.
• 高质量的工作流程的一致应用比方法的普遍标准化更为关键.
• 规范化策略可能需要对工作流进行特定的调整.
• 优化样本存储对于准确检测SARS-CoV-2RNA至关重要.