从离子移动性质谱碰撞横截面数据中分配体结构.
Mithony Keng1, Kenneth M Merz1,2
1Department of Chemistry, Michigan State University, East Lansing, Michigan 48824, United States.
与质谱学 (IM-MS) 结合的离子流动性有助于结构分析. 准确的预测需要广泛的 conformational 采样和适当的量子力学方法来建模气相相互作用.
科学领域:
- 计算化学是一种计算化学.
- 分析化学是一种分析化学.
- 生物物理学的生物物理.
背景情况:
- 与质谱学 (IM-MS) 结合的离子流动性是特征离子的强大工具.
- 碰撞横截面 (CCS) 值提供了分子层面的洞察力,可以了解体构造.
- 由于动态气相分子内相互作用,准确预测结构具有挑战性.
研究的目的:
- 使用IM-MS数据系统地评估用于阐明结构的计算工作流.
- 调查构造性采样和量子力学层面理论对CCS预测准确性的影响.
- 建立基于实验CCS值的可靠方法来分配结构.
主要方法:
- 利用结合古典和密度函数理论 (DFT) 方法的计算工作流.
- 进行了广泛的列举和优化形状.
- 使用的D3-B3LYP/6-31G(d) 和随后的6-31G(d,p) 为量子力学计算的基础集.
主要成果:
- 通过适当的 conformational 采样,实验和计算的 CCS 值之间取得了良好的一致性.
- 将基础设置增加到6-31G (d,p) 提高了在非最佳协议的情况下的准确性.
- 这项研究证明了准确的结构分配的可行性.
结论:
- 通过全面的构造空间采样,可以实现精确的质结构赋值.
- 适当的量子力学理论水平对于建模气相分子内部相互作用至关重要.
- 开发的计算工作流提供了使用IM-MS.的可靠方法来阐明结构.
更多相关视频
11:04Ion Mobility-Mass Spectrometry Techniques for Determining the Structure and Mechanisms of Metal Ion Recognition and Redox Activity of Metal Binding Oligopeptides
Published on: September 7, 2019
11:44Synthesis and Mass Spectrometry Analysis of Oligo-peptoids
Published on: February 21, 2018
相关概念视频
Peptide Identification Using Tandem Mass Spectrometry
This technique helps gather information regarding the protein from which the peptide was obtained and to study the peptides’ amino acid sequence. Identifying peptides from a complex mixture is an important component of the growing field of...
Mass Spectrometry: Carboxylic Acid, Ester, and Amide Fragmentation
For example,...
Mass Spectrometry: Overview
Chemical Ionization (CI) Mass Spectrometry
MALDI-TOF Mass Spectrometry
Matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI) is a commonly...
Mass Spectrometry: Amine Fragmentation
In amines, the number of nitrogen atoms affects the mass of the molecular ion, which is described by the nitrogen rule of mass spectrometry. This rule states that a compound containing...
