基因组规模的代谢模型引导的系统框架,用于设计定制的活生物治疗产品
Yi Qing Lee1, Yoon-Mi Choi1, Seo-Young Park1,2
1School of Chemical Engineering, Sungkyunkwan University, Suwon, Republic of Korea.
NPJ systems biology and applications
|July 7, 2025
概括
开发活生物治疗产品 (LBPs) 需要严格的评估. 本研究引入了基因组规模代谢模型 (GEM) 框架,以表征LBP及其相互作用,以改善治疗开发.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 系统生物学 系统生物学
- 生物工程是生物工程.
背景情况:
- 活生物疗法产品 (LBPs) 是基于微生物组的有前途的治疗类.
- 开发LBP需要对其质量,安全性和有效性进行严格的评估.
- 描述复杂的微生物群落及其与宿主之间的相互作用对于LBP成功至关重要.
研究的目的:
- 为开发活生物治疗产品 (LBPs) 提出一个以模型为导向的框架.
- 为了证明基因组尺度代谢模型 (GEMs) 在表征LBP候选菌株中的实用性.
- 概述使用GEM进行查,评估和设计个性化的多菌株LBP的策略.
主要方法:
- 利用基因组规模的代谢模型 (GEMs) 来分析LBP候选菌株的代谢能力.
- 在系统层面上模拟LBP菌株,共生微生物和宿主细胞之间的代谢相互作用.
- 开发基于GEM的战略,用于系统评估和设计LBP.
主要成果:
- 拟议的GEM指导框架允许对LBP进行全面的表征.
- 基因基因组有助于理解LBP,微生物组和宿主之间的代谢交叉对话.
- 该战略支持量身定制的多菌株LBP配方的选和设计.
结论:
- 基因组规模的代谢模型为LBP发展提供了强大的系统级方法.
- 这一框架加强了对LBP质量,安全性和有效性的严格评估.
- 提出的战略为基于微生物组的个性化疗法铺平了道路.
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