通过莱克微阵列对Lacticaseibacillus paracasei的突变体进行甘类型鉴定
Emi Suzuki1, Masaki Serata2, Tomoyuki Sako3
1Quality Assurance Unit, Yakult Central Institute, Yakult Honsha Co., Ltd., Kunitachi-shi, Tokyo, Japan.
Applied and environmental microbiology
|July 9, 2025
概括
这项研究使用莱克微阵列和Lacticaseibacillus paracasei YIT 9029的突变菌株来识别与细胞表面多糖相关的细菌基因功能. 这种方法有效地揭示了影响细菌葡萄糖的基因功能.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 葡萄糖生物学 葡萄糖生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 乳糖糖菌种 (Lacticaseibacillus paracasei) 菌株Shirota (YIT 9029) 拥有细胞表面长链多糖 (LCPS-1) 生物合成的基因集群,这会影响其免疫细胞活性.
- 莱克微阵列有效地区分细菌细胞表面的多糖体 (PS) 结构.
研究的目的:
- 为了研究51个基因的功能预测参与细胞壁PS生物合成在YIT 9029.
- 用先进的莱克微阵列来描述YIT 9029及其突变的细胞表面糖化特性.
主要方法:
- 在YIT 9029.29中为51个基因生成破坏性突变菌株.
- 突变菌株的莱克结合特征和单克隆抗体 (MAb) 结合能力的比较.
- 使用莱克微阵列分析细胞表面糖化,包括特定于拉姆诺斯 (Rha),O-甘氨酸和曼诺斯 (Man) 结合的莱克.
- 通过基因补充和碳水化合物抑制试验证实了莱克结合特异性.
主要成果:
- 具有MAb结合缺陷的突变者在cps1基因集群中表现出改变,这表明他们参与LCPS-1合成和成熟.
- 通过cps1J淘汰突变,观察到单个cps1A通过cps1J淘汰突变的明显的莱克结合特征,从而可以预测基因功能.
- YIT 9029对糖 (Rha) 特定的莱克CSA,rDiscoidin II (O-glycan结合剂),以及曼 (Man) 结合的莱克rOrysata和rBanana进行了特定的结合.
结论:
- 莱克微阵列和YIT 9029突变菌株库的联合使用是识别与细胞表面糖核相关的未知细菌基因功能的强大工具.
- 这种方法提供了一种新的方法,用于甘类型和确定与细菌基因功能相关的细胞壁糖体.
