基于Amplicon的下一代定向测序,使用干血斑用于46,XY差异/性别发育障碍:旨在通过最小侵入性测试进行诊断
Erika Uehara1,2, Kazuhisa Akiba1,3, Keiko Matsubara1,3
1Department of Molecular Endocrinology, National Research Institute for Child Health and Development, Tokyo, Japan.
概括
现在可以在干血斑点上使用基于AMPLICON的下一代测序 (NGS) 进行46XY性发育障碍 (DSD) 的快速遗传测试. 这种最少的侵入性方法提供更快的结果,并且需要比传统方法少得多的DNA.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 分子生物学分子生物学
- 儿科 儿科 儿科
背景情况:
- 对性别发育差异/障碍 (DSD) 的最小侵入性基因测试对于及时诊断至关重要.
- 当前的遗传诊断方法可能是侵入性的,耗时的.
研究的目的:
- 评估PCR基于amplicon的下一代测序 (NGS) 使用干血斑点 (DBS) 快速基因诊断在46,XY DSD.的有效性.
- 为了将基于DBS的NGS与传统的基于静脉血液的NGS进行AR和SRD5A2基因分析.
主要方法:
- 从22名患有46,XY DSD的患者的DBS中提取DNA.
- 基于PCR片的NGS向AR和SRD5A2基因.
- 使用静脉血液DNA与基于捕获的外包NGS进行比较.
主要成果:
- 在七天内成功从DBS中提取和分析22例中的19例的DNA.
- 与基于静脉血液的NGS相比,基于DBS的NGS所需的DNA数量显著较低 (8.7 ng与1434.8 ng).
- 在16个案例中确定了4个单核酸替代SRD5A2,方法之间的一致性很高,除了一个潜在的等位基脱落的案例外.
结论:
- 使用DBS的基于AMPlicon的NGS可以对46,XY DSD进行快速,最少侵入性的基因测试.
- 这种方法需要大大减少DNA,并提供更快的周转时间.
- 优化从DBS和桑格测序验证中提取DNA的建议是为了准确性.
