在Arabidopsis中用于基于TurboID的近距离标记质谱的生物化蛋白质的检测和量化
Sumudu S Karunadasa1,2, TaraBryn S Grismer1,2, Wenxuan Zhai1,2
1Department of Plant Biology, Carnegie Institution for Science, Stanford, CA, USA.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
|July 10, 2025
概括
与质谱学 (PL-MS) 相结合的TurboID近距离标签识别可以识别相互作用的蛋白质. 本协议详细介绍了对Arabidopsis的样本制备和用于蛋白质识别的数据分析.
科学领域:
- 植物生物学 植物生物学
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 基于TurboID的近距离标签与质谱法 (PL-MS) 结合在一起是一种强大的技术.
- 它在植物和动物研究中广泛用于各种应用.
研究的目的:
- 为TurboID-PL-MS提供使用Arabidopsis组织制备样本的详细方案.
- 提供数据分析策略和用于蛋白质识别的软件的概述.
主要方法:
- 使用工程化生物素结合酶,TurboID 融合到一个诱蛋白.
- 在生物治疗后,生物化近接蛋白质.
- 使用斯特雷普塔维丁珠和质谱学分离和识别生物化蛋白质.
主要成果:
- 在Arabidopsis中成功应用TurboID-PL-MS.
- 建立了一种可靠的方法来识别和量化生物化蛋白质.
结论:
- 该协议允许在植物中进行可靠的蛋白质-蛋白质相互作用研究.
- 使用TurboID-PL-MS.便于识别新的蛋白质相互作用体.


