土壤传播的虫的全球多样性揭示了受人口偏差影响诊断目标的遗传变异

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 寄生虫学的寄生虫学
• 分子诊断学 分子诊断

背景情况:

• 土壤传播的虫 (STHs) 是一个主要的全球健康问题,影响超过10亿人.
• 目前的STH控制依赖于显微镜,但分子诊断提供更高的灵敏度,特别是在低流行地区.
• 了解虫的遗传多样性对于分子诊断工具的有效性至关重要.

研究的目的:

• 评估STH在不同地理区域的遗传多样性和连接性.
• 调查人类和猪感染的虫物种之间的神秘遗传多样性.
• 评估遗传变异对分子诊断,特别是qPCR的性能的影响.

主要方法:

• 来自27个国家的STH样本 (虫,便,蛋) 的低覆盖基因组测序.
• 对STH种群内部和之间遗传连接和多样性的分析.
• 在体外验证基因变异对qPCR诊断试验的影响.

主要成果:

• 在不同地区的STH的遗传连接性和多样性中发现了显著的差异.
• 在密切相关的人类和猪感染物种之间发现了神秘的遗传多样性.
• 定义了当前分子诊断所针对的区域内的大量副本数和序列变异.
• 验证了基因变异会影响qPCR诊断性能.

结论:

• 虫的遗传多样性为分子诊断带来了挑战和机会.
• 基因组洞察对于开发用于STH监测和控制的准确和可靠的分子工具至关重要.
• 需要进一步研究STH基因组流行病学,以支持全球控制工作.