B4GALT3作为多发性骨髓瘤进展中的关键葡萄糖转移酶基因:来自生物信息学,机器学习和实验验证的见解

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 生物化学 生物化学

背景情况:

• 糖基化异常与癌症进展有关.
• 糖系转移酶 (GT) 在多发性骨髓瘤 (MM) 发病和预后中的作用尚不清楚.

研究的目的:

• 为了确定MM的GT相关生物标志物.
• 使用GT相关基因开发MM的预后模型.
• 阐明MM中已识别的生物标志物的功能机制.

主要方法:

• 利用MMRF-CoMMpass和GSE57317数据集提取GT相关的基因.
• 应用了考克斯回归和拉索分析来识别生物标志物.
• 使用机器学习开发了一种与糖转移酶相关的预后模型 (GTPM).
• 在MM细胞中通过IHC,qPCR,Western blot和敲击实验验验证了B4GALT3的表达和功能.

主要成果:

• GTPM有效地将MM患者分为高风险和低风险组,在低风险组显著改善存活率 (HR=55.94,p<0.001).
• 该GTPM实现了高AUC值 (0.98为1年,0.99为3年生存),超过了现有的签名.
• 升高的B4GALT3表达与晚期MM阶段和较差的存活率相关;它的敲击减少了MM细胞的增殖和入侵,同时增加了细胞亡.
• 发现B4GALT3通过Wnt/β-catenin/GRP78通路调节MM细胞的行为,通过调节内质网膜 (ER) 应激.

结论:

• 开发了一种新的GTPM,为预测多发性骨髓瘤患者的存活率提供了一个强大的工具.
• B4GALT3被确定为MM进展中的关键基因,通过ER压力和Wnt/β-catenin通路起作用.
• B4GALT3具有作为多发性骨髓瘤预后生物标志物和治疗点的潜力.