通过核细胞质谱测量对多价值染色体阅读器与核细胞体相互作用的直接读取

科学领域:

• 表观遗传学和染色体生物学
• 质谱测量质量谱测量
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 基因组转化后修改 (PTMs) 对于表观基因组调节至关重要,它会招募染色质相关蛋白 (CAPs).
• 使用基因组的CAP-PTM相互作用的研究忽略了完整核细胞体上的多位点结合.

研究的目的:

• 开发和应用一种原生自上而下的质谱法 (MS) 方法,核质谱法 (Nuc-MS),用于分析CAP:核复合体.
• 描述驱动各种合阅读器与核细胞体结合的特定组分蛋白和PTM的特征.

主要方法:

• 核质谱学 (Nuc-MS):一种自主上下MS技术,用于控制CAP:核体复合物的分解.
• 在完整的CAP:nuc复合体内分析基因组蛋白形和组合型PTM.

主要成果:

• 经过证明的BPTF PHD-BD阅读器需要一致的H3K4me3K9acK14acK18ac来进行核细胞参与.
• BRD4 (BD1-BD2) 支持二-和三-乙化素H4蛋白质形式.
• DNMT3A-MPP8和PtSHL优先与高甲基化H3蛋白形相互作用,包括组合性的H3K4me3K27me3.

结论:

• 在CAP:nuc复合体内,Nuc-MS提供了直接读取CAP:nuc复合体内的组织组织蛋白质形式,揭示了PTM驱动的结合.
• 这种方法扩大了对双价性基因组标记的理解,并确定了结构和基因组研究的关键修改.