MethAgingDB:一个全面的DNA甲基化数据库,用于衰老生物学.
Siyu Li1, Songming Tang1, Haocheng Ma2
1School of Mathematical Sciences and LPMC, Nankai University, Tianjin, 300071, China.
Scientific data
|July 14, 2025
概括
研究人员创建了MethAgingDB,这是一个新的DNA甲基化数据数据库. 该资源有助于理解生物年龄,并通过组织表观遗传时钟信息来开发衰老生物标志物.
科学领域:
- 生物老龄化 生物老龄化
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 量化生物年龄对于衰老研究和干预至关重要.
- 使用DNA甲基化的表观遗传钟是关键工具,但数据的可访问性有限.
- 现有的资源缺乏全面的,均格式的DNA甲基化数据集和老化特异性差异甲基化站点/区域.
研究的目的:
- 开发MethAgingDB,一个集中式,公开可访问的数据库,用于与衰老相关的DNA甲基化数据.
- 解决数据可访问性,标准化和特定衰老特异性表观遗传标记物识别方面的挑战.
- 促进对表观遗传钟的研究和衰老生物标志物的开发.
主要方法:
- 编制了93个DNA甲基化数据集,包括11,474个人类和1,361个小鼠组织档案.
- 将预处理的数据转化为一致的矩阵格式.
- 综合组织特定的差异甲基化位点 (DMSs) 和区域 (DMRs),基因中心的衰老洞察力和表观遗传钟.
主要成果:
- MethAgingDB提供了一个全面的资源,包含来自13个人类和9个小鼠组织的数据.
- 该数据库提供标准化DNA甲基化数据,DMS,DMR和表观遗传钟的集合.
- 简化了对衰老研究的关键数据的更容易获取.
结论:
- MethAgingDB显著简化了与衰老相关的表观遗传研究.
- 该数据库支持开发强大的,生物知情的衰老生物标志物.
- 加强了对衰老过程背后的表观遗传机制的研究.


