在基于生物信息学分析的脊髓损伤中识别与热和炎症相关的基因

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 免疫学 免疫学 免疫学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 脊髓损伤 (SCI) 是神经功能障碍的主要原因.
• 炎症性细胞死亡,特别是热,在SCI病变发生过程中发挥着关键作用.
• 在SCI中热的精确分子机制在很大程度上仍未定义.

研究的目的:

• 用生物信息学来识别与SCI相关的灭相关基因 (PRGs).
• 研究差异表达PRG (DEPRG) 在炎症反应中的作用.
• 在SCI.中探索DEPRG,微RNA (miRNA),长非编码RNA (lncRNA) 和圆形RNA (circRNA) 之间的潜在调节相互作用.

主要方法:

• 从基因表达综合 (GEO) 数据库中获取的RNA表达特征.
• 通过文献搜索确定了78个PRG,并使用R软件对DEPRG,miRNA,lncRNA和circRNA进行了选.
• 进行了功能丰富分析,构建了蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 和竞争性内源RNA (ceRNA) 网络,并进行了权重基因同表达网络分析 (WGCNA).

主要成果:

• 在SCI中鉴定了11个DEPRG,其中包括介质白蛋白-1β生产和炎症酶通路的丰富.
• 发现了两个枢纽基因,IL18和GSDMD,与SCI和热症有很强的关联.
• 发现枢纽基因和免疫细胞 (如M1巨细胞和CD8+T细胞) 之间存在显著的相关性,以及已识别的调节性miRNA,lncRNA和circRNA.

结论:

• 生物信息学分析显示,热和SCI之间存在显著的关联.
• IL18和GSDMD被确定为SCI相关的热和免疫反应的潜在关键调节剂.
• 这些发现为SCI机制和潜在的治疗点提供了新的见解.