跨物种蛋白质组学量化管道在探索的生物材料中区分捐赠者与宿主细胞外基质

科学领域:

• 生物材料科学 生物材料科学
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 异种移植研究 异种移植研究

背景情况:

• 外源生物材料的耐用性,特别是在生物假体心脏门 (BPVs) 中,受到病态细胞外基质 (ECM) 改造和退化的限制.
• 基于质谱的蛋白质组学为BPV退化提供了洞察力,但供体和宿主物种之间的序相似性使蛋白质水平分析复杂化.

研究的目的:

• 开发和验证异源生物材料的跨物种蛋白质组分析策略.
• 为了准确量化牛起源的人类生物假体心脏膜 (BPVs) 退化的蛋白质丰度.
• 为了应对物种之间的重叠和高蛋白质身份所带来的挑战.

主要方法:

• 开发了一种"in silico"的三性消化方法,以识别人类和牛的数据库之间的重叠蛋白质.
• 使用质谱学分析了人体BPV组织,并根据退行症的严重程度划分样本.
• 采用了级,物种划分的蛋白质量量定量策略.

主要成果:

• 确定了400多种重叠的蛋白质,在人类和牛蛋白质之间具有高序列一致性.
• 量化了特定物种的蛋白质丰度,揭示了人类和牛的ECM蛋白质的退化区域特定沉积.
• 证明单个物种蛋白质组分析导致异源环境中不准确的量化.

结论:

• 区分供体和宿主蛋白质组对于精确量化异源生物材料中的蛋白质至关重要.
• 介绍的跨物种蛋白质组战略增强了对BPV退化机制的理解.
• 这种方法广泛适用于异种移植和对其他异种基因的分析.