古代气候变化和放松的选择塑造了北美洞穴殖民的洞穴殖民 洞穴鱼

科学领域:

• 进化生物学是进化的生物学.
• 基因组学就是基因组学.
• 古气候学 古气候学

背景情况:

• 像洞穴这样的极端环境为进化过程提供了洞察力.
• 生物的洞穴殖民是一个反复出现的现象,但它的时间和遗传基础尚不清楚.
• 北美Amblyopsidae鱼提供了一个模型系统,包括表面,选择性和义务性洞穴居住物种.

研究的目的:

• 阐明Amblyopsidae鱼类洞穴殖民的进化历史和适应过程.
• 为了确定独立洞穴殖民的时间和方式.
• 研究适应洞穴环境的遗传基础.

主要方法:

• 使用1105个外基因标记物的基因组学分析.
• 总证据约会包括化石数据.
• 古气候模型. 古气候模型.
• 对487个候选基因进行比较基因组分析.

主要成果:

• 一个强大的分类学证实了盲洞穴鱼内可选洞穴居民的嵌套位置.
• 三个独立的洞穴殖民被追溯到米奥生早期 (18.5万年前),米奥生晚期 (10.0万年前) 和普略生 (3.0万年前).
• 对比基因组学揭示了与巨形态相关的基因的放松和强化选择,放松选择的流行支持中性突变的作用.

结论:

• 洞穴殖民在Amblyopsidae很可能是由气候变化驱动的,支持气候依赖假设.
• 中性突变在洞穴义务物种的进化中起着重要作用.
• 这项研究提供了关于在极端环境中塑造生命的复杂选择性压力的见解.