基于结直肠癌损伤相关分子模式的预后预测模型的开发,应用大量RNA-seq分析
Yang Wu1, Yangjing Xu2, Yongtong Chen2
1Digestive Endoscopy Center, Affiliated Guangdong Hospital of Integrated Traditional Chinese and Western Medicine of Guangzhou University of Chinese Medicine, Foshan, 528253, China.
Scientific reports
|July 16, 2025
概括
一种新的结直肠癌 (CRC) 风险模型使用损伤相关分子模式 (DAMPs) 预测患者的结果. 这个DAMP签名识别了高风险患者,他们可能会从向治疗和改进诊断中受益.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 结肠直肠癌 (CRC) 的预后仍然具有挑战性.
- 与损伤相关的分子模式 (DAMPs) 在癌症生物学中发挥着作用.
- 对CRC的预测生物标志物对于个性化治疗至关重要.
研究的目的:
- 开发基于损伤相关分子模式 (DAMPs) 的结直肠癌 (CRC) 患者的预后风险模型.
- 确定用于预测CRC患者结果的新生物标志物.
- 探索DAMPs,免疫透和CRC治疗反应之间的关系.
主要方法:
- 利用了来自癌症基因组图谱 (TCGA) 和cBioportal.com的数据.
- 使用ssGSEA方法计算了DAMP得分.
- 识别了差异表达基因 (DEGs),并构建了一个基于拉索-考克斯回归的风险模型和名录.
- 进行了生存分析,免疫透分析和药物敏感性分析.
主要成果:
- 建立了一个由9个生物标志物组成的DAMP签名,形成了一个具有高预测精度 (AUC) 的可靠风险模型.
- 通过模型识别的高风险患者表现出更糟糕的预后结果.
- 低风险患者表现出增加的免疫透,潜在的免疫疗法益处,以及免疫相关途径的丰富.
结论:
- 已经开发出一种新的可靠的基于DAMP的结直肠癌 (CRC) 风险标志.
- 这种特征有助于预后预测,并可指导CRC的诊断和治疗策略.
- 这些发现突显了DAMP在了解CRC进展和治疗反应方面的潜力.
