探索循环circRNA和miRNA生物标记面板,通过多个omics分析来早期检测卵巢癌

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 生物标志物发现发现

背景情况:

• 循环RNAs (circRNAs) 越来越多地被认为是它们在癌症中的生物学作用.
• 作为卵巢癌 (OC) 的早期检测生物标志物,circRNAs的潜力在很大程度上仍未被探索.
• 了解OC中的circRNA功能对于开发新型诊断策略至关重要.

研究的目的:

• 识别和功能性描述与卵巢癌相关的circRNAs.
• 评估circRNAs及其组合作为OC生物标志物的诊断性能.
• 探索circRNA-miRNA检测 (CMD) 面板用于早期OC检测的潜力.

主要方法:

• 在OC细胞系上进行RNA测序,以识别差异表达的circRNAs.
• 生物信息学分析,包括circRNA-miRNA-mRNA网络构造和通路分析,用于阐明功能机制.
• 候选circRNAs和miRNAs的表达特征在临床样本 (细胞,组织,血) 中得到验证.
• 采用接收器操作特征 (ROC) 分析来评估单个标记物和CMD面板的诊断准确性.

主要成果:

• 发现170个已知的circRNA与卵巢癌相关.
• 一个监管网络确定了9个circRNA与8个miRNA相互作用,针对324个参与MAPK,Wnt和ErbB信号通路的mRNA.
• 四个候选生物标志物 (hsa_circ_0049101,hsa_circ_0007440,hsa_circ_0006935,和hsa-miR-338-3p) 显示与OC发育有正相关性.
• 与CA125,HE4和ROMA指数相比,组合的CMD小组显示出更高的诊断能力.
• 在CMD小组取得的曲线下的面积 (AUC) 为1的区分早期的OC从健康对照.

结论:

• 多omics分析阐明了OC中的特定circRNAs的功能作用.
• 一个组合circRNAs和miRNAs (CMD面板) 的面板显示了早期检测卵巢癌的巨大潜力.
• CMD小组提供了一个有前途的,高度准确的OC诊断工具,优于目前的生物标志物.